23 декабря 1967 года было издано Постановление Совета Министров СССР № 1145 за подписью Председателя Совмина «О создании военизированных частей и отрядов по предупреждению возникновения и по ликвидации открытых нефтяных и газовых фонтанов».
Одной из первых была создана Военизированная часть Северо–Кавказского промышленного района, в состав которой входил Ахтырский военизированный отряд.
В связи с событиями, произошедшими в 1990—1992 годах, образование Союза независимых государств, приказом №2 от 15 января 1992 года, объединением «Фонтанная безопасность» Министерства топлива и энергетики, была создана в пос. Ахтырском Краснодарского края Южно-Российская противофонтанная военизированная часть на правах структурной производственной единицы.
В связи с возросшими задачами и объёмом выполняемых работ, а также в целях улучшения координации деятельности военизированных отрядов, приказом Министерства энергетики РФ, в 1997 году штаб части был переведен в г. Краснодар.
В состав части первоначально вошли Ахтырский, Волгоградский и Ставропольский отряды, а также Арктический и Сахалинский отряды, ранее входившие в состав военизированной части Украинского промышленного района — г. Полтава.
В 1993 году к части был присоединён Дагестанский военизированный отряд, а в 1996 году — Северный отряд.
С 1994 года учредителем части, как самостоятельного юридического лица, является Министерство энергетики Российской Федерации.
С 1995 года часть аттестована Центральной ведомственной комиссией в качестве профессионального аварийно-спасательного формирования.
В 1996 году, по решению Министерства топлива и энергетики, Арктический отряд был передан в состав фирмы «Газобезопасность» РАО «Газпром», а в 1999 году на базе Сахалинского отряда решением Министерства была создана Дальневосточная противофонтанная военизированная часть.
В 1996 году приказом № 23 от 2 февраля Министерства энергетики РФ Аварийно-спасательное формирование Южно-Российская противофонтанная часть преобразована в Государственное предприятие.
В 2001 году, во исполнение приказа Министерства энергетики РФ, был образован в составе Южно-Российской части Грозненский военизированный отряд, ранее входивший в ОАО «Грознефтегаз».
7 декабря 2001 года распоряжением № 262 часть переименована в Федеральное государственное учреждение Аварийно-спасательное формирование «Южно-Российская противофонтанная военизированная часть» (ФГУ АСФ ЮРПФВЧ).
В 2003 году в составе Южно-Российской противофонтанной части был образован Астраханский военизированный отряд, а в 2006 году — Усинский и Красноярский военизированные отряды.
Распоряжением Правительства Российской Федерации от 04.02.2011 г. № 121-р ФГУ АСФ "ЮРПФВЧ" преобразованно в ФКУ "АСФ "ЮРПФВЧ" (изменения зарегистрированны в ИФНС России № 1 г. Краснодара 06.06.2011 г.)
Приказом Мининистерства Энергетики Российской Федерации №995 от 21.12.2015 г. с 1 января 2016 года Федеральное казенное учреждение "Аварийно-спасательное формирование "Южно-Российская противофонтанная военизированная часть" преобразовано в Федеральное государственное автономное учреждение "Аварийно-спасательное формирование "Южно-Российская противофонтанная военизированная часть"(изменения зарегистрированны в ИФНС России № 1 г. Краснодара 14.01.2016 г.)